在女性患者中，急性细菌性膀胱炎应与其他泌尿生殖系统感染区分开来。外阴阴道炎和膀胱炎有相似的症状，但通过盆腔检查和阴道分泌物可以明确诊断致病菌。急性尿道综合征可引起尿频和疼痛，但尿培养菌落计数低或无菌生长。急性肾盂肾炎可能有膀胱刺激症状，但腰痛和发烧。

 

　　在儿童中，一些洗涤剂或虫会引起类似于膀胱炎的外阴和尿道刺激症状。

 

　　在男性患者中，急性细菌性膀胱炎应与尿道、前列腺和肾脏感染区分，并可通过适当的身体和实验室检查来区分。

　　非感染性膀胱炎的症状与细菌性膀胱炎相似，如抗肿瘤治疗 (放疗、化疗) 引起的膀胱炎、间质性膀胱炎、嗜酸性膀胱炎、膀胱肿瘤等。

 

　　急性肾盂肾炎需要与急性膀胱炎区分开来。除了膀胱刺激，前者还有寒战、高热和肾脏撞击疼痛。

 

　　结核性膀胱炎发展缓慢，表现出慢性膀胱炎的症状，药物治疗反应不佳，尿液中可以发现抗酸杆菌，尿路造影显示受影响的肾脏中有结核病。

 

　　膀胱炎和间质性膀胱炎的区别，后者尿清，脓细胞少，无细菌，膀胱充盈时剧痛, 在耻骨上的膀胱区域可以到达一个完整而柔软的膀胱。

 

　　嗜酸性膀胱炎的临床表现与一般膀胱炎相似，只是尿液中有嗜酸性粒细胞和大量膀胱粘膜浸润。膀胱炎和腺性膀胱炎的鉴别诊断主要依靠膀胱镜检查和活检。